Lviv IT Arena

Несподівано для себе отримала цікаве запрошення і так само несподівано для себе погодилась.

На початку жовтня, а саме з 2го по 4те, у Львові відбудеться вже традиційна найбільша ІТ конференція Західної України на стадіоні “Арена Львів”. І я там буду. Спитаєте, а я яким боком до програмістів і компьютерщиків? Пояснюю.

20 років тому, коли я починала свої перші біологічні дослідження, то 99% часу я проводила в лабораторії, а компьютер використовувася аби зручно набрати і роздрукувати результати. Сьогодні все виглядає навпаки: лише 1% часу проводиться на полях і в лабораторії, а решту часу - це компьютерне обчислювання. Аналітичні технології так рвонули, що біологи не встигають осмислити гігантську кількість результатів, тому без допомоги програмістів не впоратись.

На мій погляд біоінформатиці в Україні приділяється дуже мало уваги. Ніби читається спецкурс в Харківському універі (оглядовий курс переважно для біологів), в Національному університеті ім. Тараса Шевченка Льоша Нипорко викладає базовий курс , КПІ має свою кафедру (також більше для біологів) і може ще десь є, але це майже все.

Відверто кажучи, біоінформатика давно вже рвонула далі геноміки і протеоміки, про яку в Україні бодай в універах розказують (і то добре), але не роблять.

Отже, маю на меті розказати про місця застосування програмування в біології. Пробіжимось галопом по оміксам (геноміці,транскриптоміці, протеоміці, метаболоміці, феноміці). Дізнаємось, які сучасні вимірювальні інструменти є і що вони вже дозволяють робити: від секвенування окремих генів до дронів над полями і повністю автоматизованих фітотронів.

Покажу, де саме біологам треба обчислювальні інструменти і які конкретно. Розкажу, які програми і алгоритми вже є і їх розробка неактуальна, які є, але ще недосконалі і що в них треба поліпшити, а яких ще досі взагалі нема. Додам, що сучасна аналітична біологія продукує просто гігантську кількість інформації і тому бази даних наше все.


Отже, до зустрічі на Lviv IT Arena 2015.
Для мордокнижників лінк тут.